1987 yılında Maliye Bakanlığında Stajyer Gelirler Kontrolörü olarak göreve başladı. Yeterlilik sınavında başarı göstererek 1990’da Gelirler Kontrolörlüğü’ne atandı. Ankara, İzmir ve İstanbul Grup Başkanlıkları’nda Gelirler Kontrolörü olarak görev yaptı. 1996 tarihinde Gelirler Kontrolörlüğü’nden ayrılan Ayhan DURGUN özel bir şirkette genel koordinatör olarak görev yaptı. Yüksek lisansını Dokuz Eylül Üniversitesi İktisadi İdari Bilimler Fakültesinde “Vergi Kayıp ve Kaçağını Önlemede Yeminli Mali Müşavirlik Kurumunun Yeri ve Önemi” adlı tezi ile bitiren Ayhan DURGUN halen Kadir Has Üniversitesi’nde doktora çalışmalarına devam etmektedir. 1997 yılında başladığı Yeminli Mali Müşavirlik mesleğini Arın Denetim Yeminli Mali Müşavirlik Anonim Şirketi’nde Yönetim Kurulu Başkanı, Arın Bağımsız Denetim Anonim Şirketi’nde 02.10.2013 tarihinden itibaren Kamu Gözetim Kurumu belgeli bağımsız denetçi ve Yönetim Kurulu Başkanı olarak görevini sürdürmektedir. Ayhan DURGUN bir dönem Türkiye Futbol Federasyonu ve Türkiye Voleybol Federasyonu Denetim Kurulu üyeliği, Isparta Spor Kulübü İkinci Başkanlığı ve Karşıyaka Spor Kulübünde As Başkanlık görevlerinde bulundu. Halen Fenerbahçe Spor Kulübü Yüksek Divan Kurulu üyesidir.